Coot es un software de código abierto diseñado para la construcción, completación y validación de modelos macromoleculares. Se utiliza principalmente en cristalografía de rayos X y cada vez más en criomicroscopía electrónica para analizar proteínas, ácidos nucleicos y ligandos. Permite visualizar mapas de densidad electrónica y manipular estructuras tridimensionales con precisión.
Alternativas a Coot
17 alternativas
Sobre Coot
Sus capacidades principales incluyen:
Refinamiento en espacio real para ajustar los modelos a los datos experimentales.
Búsqueda de ligandos y ajuste de rotámeros en sitios activos.
Simetría no cristalográfica para manejar ensamblajes proteicos complejos.
Scripting en Python mediante la interfaz chapi para automatizar tareas.
Visualización de mapas y modelos con esquemas de color avanzados.
El programa funciona en Linux, Windows y macOS, y está disponible bajo licencias GPL y LGPL. No requiere suscripción ni cuenta de usuario, lo que lo hace accesible para grupos de investigación y académicos que necesitan herramientas de estructura proteica sin costes de licencia.
iSpring Suite es una herramienta de autoría educativa instalada como complemento de Microsoft Office, diseñada para transformar presentaciones PowerPoint, documentos Word y PDF en cursos de aprendizaje en línea. Permite a formadores, metodólogos y equipos de RR. crear materiales interactivos sin necesidad de conocimientos de programación, aprovechando el entorno de trabajo habitual de la oficina.
Frente a Coot: es propietaria (Coot es de código abierto), es de pago (prueba gratuita), funciona también en Windows y no tiene versión para Linux.
OpenChrom es una herramienta de código abierto desarrollada por Lablicate para el análisis y la visualización de datos analíticos en química. Su enfoque principal es la cromatografía y la espectrometría de masas nominal, aunque también ofrece soporte básico para técnicas como HPLC-UV/VIS, FTIR, PCR y NMR. La aplicación se centra exclusivamente en el procesamiento de datos, sin capacidades de adquisición o control de hardware de terceros.
Frente a Coot: funciona también en Mac y Windows, admite plugins, es ligera y existe desde 2010.
Deine Rechte es una aplicación gratuita y de código abierto para Android, desarrollada por jfriedli, que ofrece información sobre los derechos de las personas en el cantón de Berna, Suiza. El objetivo principal es informar sobre las limitaciones legales de la policía, la fiscalía y los servicios de seguridad privados, permitiendo a los usuarios conocer qué acciones están permitidas y cuáles no en situaciones de control, acusación o exclusión de espacios públicos.
Frente a Coot: funciona también en Android, no tiene versión para Linux, está en español y está centrada en la privacidad.
JChemPaint es una aplicación de software libre diseñada para la edición y visualización de estructuras químicas en dos dimensiones. Desarrollada en Java y basada en el Chemistry Development Kit (CDK), permite trabajar con moléculas mediante gráficos 2D. El proyecto, iniciado por Christoph Steinbeck, se distribuye bajo licencias Eclipse Public License y GNU Lesser General Public License, lo que garantiza su carácter de código abierto.
Frente a Coot: funciona también desde el navegador y existe desde 2012.
Kalzium es una aplicación de escritorio desarrollada por KDE que sirve como herramienta educativa para el estudio de la química. Su función principal es mostrar la tabla periódica de los elementos y facilitar el acceso a datos técnicos como puntos de fusión, afinidad electrónica, configuración de electrones, radios atómicos, masa y energía de ionización. Además, permite visualizar isótopos y ofrece vistas personalizadas de la tabla, incluyendo simuladores de temperatura y separación por bloques químicos.
Frente a Coot: está en español, está centrada en la privacidad y funciona sin conexión.
Molsketch es una herramienta de software libre diseñada para el dibujo de representaciones esquemáticas bidimensionales de moléculas. Su objetivo principal es facilitar la creación de estructuras químicas de forma rápida y sencilla, sin comprometer la calidad visual del resultado final. Está desarrollado en C++ y distribuido bajo la licencia GNU General Public License versión 2.0, dirigiéndose principalmente a usuarios de Linux que necesiten generar diagramas moleculares para documentos, presentaciones o sitios web.
Frente a Coot: se usa sin registrarse, es ligera y existe desde 2014.
Avogadro es una herramienta de edición y visualización molecular de código abierto, diseñada para uso en química computacional, modelado molecular, bioinformática y ciencia de materiales. Permite construir, modificar y analizar estructuras químicas, desde moléculas simples hasta cristales y biomoléculas, ofreciendo una interfaz intuitiva tanto para estudiantes como para investigadores avanzados.
Frente a Coot: funciona también en Mac y Windows, admite plugins y existe desde 2012.
EndNote es una herramienta de gestión de referencias diseñada para el ámbito académico y científico. El programa se integra con el flujo de trabajo de escritura para facilitar la creación de ensayos, artículos y tesis.
Frente a Coot: es propietaria (Coot es de código abierto), es de pago, funciona también en Mac y Windows y desde el navegador y no tiene versión para Linux.
PoMiDAQ es una herramienta de adquisición de datos para investigación neurocientífica con miniescopios UCLA. Permite grabar vídeos, generar Z-stacks para visualizar tejidos y aplicar sustracción de fondo en línea para evaluar la actividad de calcio celular durante la grabación.
Frente a Coot: admite plugins y existe desde 2019.
CutePeaks es un visor de archivos de trazas Sanger desarrollado en C++ con el marco Qt5. Está diseñado para ofrecer una interfaz sencilla para la visualización y análisis básico de datos de secuenciación, soportando específicamente los formatos AB1 y SCF 3.0.
Frente a Coot: tiene versión portable y existe desde 2017.
Nucleus es una aplicación de escritorio diseñada para el entorno GNOME que permite explorar la tabla periódica de los elementos químicos. Desarrollada en Python utilizando GTK4 y libadwaita, ofrece una interfaz moderna para consultar información detallada sobre cada elemento, incluyendo representaciones visuales de sus propiedades.
Frente a Coot: se usa sin registrarse y funciona sin conexión.
Syntalos es una herramienta diseñada para la adquisición de datos paralelos y sincronizados por marca de tiempo en experimentos científicos, especialmente en neurociencia y comportamiento in vivo. Integra fuentes como cámaras, microendoscopios y amplificadores de electrofisiología, alineando las marcas de tiempo para facilitar la correlación de datos sin procesamiento adicional.
Frente a Coot: admite plugins y existe desde 2017.
LG4X-V2 es una aplicación de escritorio de código abierto diseñada para el análisis y ajuste de curvas en espectroscopía de fotoelectrones de rayos X (XPS). Desarrollada por Julian Andreas Hochhaus, esta herramienta se basa en el paquete Python lmfit y utiliza PyQt5 para su interfaz gráfica, facilitando la validación de resultados y la consistencia de los procedimientos de ajuste.
Como Coot, es gratis y funciona en las mismas plataformas.
Hay 17 alternativas a Coot para Windows, Mac, Linux, Android y Web. La mejor alternativa gratuita es OpenChrom, que además es de código abierto. Otras opciones destacadas: iSpring Suite, Tellico y Deine Rechte. 5 están disponibles en español. Actualizado en noviembre de 2026.
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