Jalview

Jalview es un programa gratuito y multiplataforma diseñado para la edición, visualización y análisis de alineamientos de secuencias múltiples. Está orientado a investigadores y bioinformáticos que necesitan explorar estructuras moleculares, anotaciones y relaciones evolutivas en datos de ADN, ARN y proteínas. La herramienta resuelve la necesidad de integrar la alineación de secuencias con la visualización estructural y el análisis estadístico en un entorno unificado.

Sus funciones principales incluyen:

• Alineamiento de secuencias para editar y gestionar conjuntos de ADN, ARN o proteínas.
• Visualización 3D de estructuras moleculares mediante integraciones con Jmol, Chimera y PyMol.
• Análisis filogenético mediante árboles y gráficos de componentes principales (PCA).
• Exploración de estructuras de ARN secundario y productos de proteínas alineados.
• Recuperación de datos de bases de datos como EMBL-EBI y redes de predicción estructural.

El software es de código abierto bajo licencia GPL, lo que garantiza su disponibilidad gratuita y transparencia. Su desarrollo está coordinado por la Universidad de Dundee y cuenta con el respaldo de organismos como ELIXIR-UK. Al ser una herramienta especializada en bioinformática, los usuarios pueden buscar alternativas si requieren integración con otros flujos de trabajo específicos o interfaces distintas para el manejo de grandes volúmenes de datos biológicos.